在醫藥生物化工行業中，發酵罐需要配套加熱冷卻控溫系統實現對系統內的溫度控制，冠亞制冷加熱冷卻控溫系統通過外部連接發酵罐實現內部的溫度控制。

因為發酵罐的溫度對發酵過程的影響很大，除去直接關系外，濕度還影響反應液的理化性質，如反應液粘度、反應液中基質和氧氣的溶解性和轉移率、部分基質的分解吸收率、發酵的動力學性質和產品的生物合成。

發酵罐的發酵溫度不僅適用于細菌的生長，也適用于代謝物的合成。隨著微生物的類型、培養基的構成、條件和成長時期的不一樣產生變化。整個發酵過程不但應選擇一種培養的溫度，并且需根據發酵的不同階段選擇不同的培養的溫度。

在實際生產中，因為發酵液體積大，難以提高的溫度，在整個發酵過程中常常選用更合適的培養的溫度，使出產量更好，或者在可能條件下適當調整。生長階段應選擇更合適的生長的溫度，產品分泌階段應選擇更合適的生產的溫度。

發酵溫度需要控制，再之前需要先測量。發酵溫度可利用溫度計或自動記錄設備進行檢測，并利用冷水、熱水或導熱油進到發酵罐夾套或蛇形管進行調節。

在工業生產中，一般使用的大型發酵罐在發酵過程中無需加熱，這是因為發酵釋放了大量的發酵熱，在這種情況下通常需要冷卻，使用自動控制或手動調節閥，加熱制冷一體機的低溫介質連接夾套或線圈，通過熱交換原理冷卻保持恒溫發酵。