在使用制藥生物加熱冷卻機前，需要檢查有無足夠的傳熱介質，有無壓力(即壓力表為零)，若出現異常，機器不能強行啟動，否則會損壞機器，甚者造成事故。

1、初次使用前要檢查冷卻水的劑量、流通情況，保持周邊環境衛生，減少清洗；

2、依據媒介不用使用不用保養手段，定期檢查泵是否有漏油，有需要的話，泵軸封也可以定期更換。

3、在管路方面，我們要根據泵浦和壓力的關系，來判斷管路是否有堵塞的現象，如果壓力過小，我們可以把發熱管取出并用工具清理，特別是系統入口的過濾器網罩，一個月清洗一次。

4、啟動前檢查膨脹槽油位，溫度計、壓力表等是否正常，打開進出口閥門開關，檢查管路連接，其周圍是否清潔無雜物，檢查電源線、控制器、溫控表等是否正常，設備控制柜電源，檢查電壓是否正常，檢查指示燈及各顯示儀表是否正常。

5、設備如果因緊急情況急停時，應迅速關閉加熱開關，同時調節冷卻功能，以便導熱油冷卻防止過熱。

6、運行完畢后，逐步降低溫度，待溫度降至常溫，停止循環泵的運行，關閉總電源做好交接班記錄。

制藥生物加熱冷卻機使用中的有機熱載體每年應對其殘碳、酸值、粘度、閃點進行分析，當有兩項分析不合格應更換熱載體。在日常生產中需要遵循操作規程，操作不當會引發事端，觸及公共，將會給操作人員造成不確定的后果。